Prerrequisitos:
Conocimientos de Química Orgánica y Farmacéutica básicos a nivel de licenciatura (Químicas, Farmacia,…).
Contenidos:
1). Modelado molecular: Geometría molecular. Propiedades moleculares. Estereoquímica. Energías moleculares. Análisis conformacional. Ejemplos seleccionados de análisis 3D.
2). Estructura y modelado de proteínas: Introducción a la estructura de las proteínas. Modelado de proteínas.
3). Estrategias en el diseño de fármacos: Objetivos en el diseño de fármacos: situaciones, posibilidades y estrategias. Relaciones estructura actividad. Diseño basado en fármacoforos. Diseño basado en la estructura. Diseño de bibliotecas dirigidas.
4). REA : Introducción y fundamentos. Fases. 3D-REAC. Ejemplos.
5). Diseño basado en fármacoforos: Análisis: imitación molecular, el papel de los compuestos activos e inactivos, generación de los farmacóforos, mapeo del receptor. Diseño: Modificación química, búsquedas en bases de datos, diseño de novo y diseño manual. Ejemplos.
6). Diseño basado en la estructura de la diana: Introducción. Análisis estructural de las dianas. Cuantificación de la energía de interacción. Diseño: Reglas y métodos. Ejemplos.
7). Quimioinformática: Introducción. Diseño de bibliotecas de compuestos. Peptidomiméticos. Predicción de ADME y propiedades
PROGRAMA DE PRÁCTICAS:
Familiarización con el entorno UNIX Manejo de programas de visualización molecular de pequeñas moléculas: análisis de las estructuras y de sus propiedades. Generación de estructuras tridimensionales de pequeñas moléculas. Cálculo de propiedades útiles para el establecimiento de relaciones estructura-actividad. Búsquedas en bases de datos de información estructural de macromoléculas Manejo de programas de visualización de macromoléculas. Determinación del sitio activo. Generación de estructuras de macromoléculas mediante homología. Generación y análisis de los complejos fármaco-diana.
Lecturas:
Lipkowitz, K., Boyd, D.B.: Reviews in Computational Chemistry, VCH Publishers, New York, 1990. Hansch, C: Comprehensive Medicinal Chemistry. Ed. Pergamon Press. U.K. 1990. Journal Medicinal Chemistry J. Gasteiger y T. Engel, Chemoinformatics. A textbook., VCH Publishers, Erlangen, 2003.
J. Gasteiger, Handbook of Chemoinformatics, VCH Publishers, Erlangen, 2003.
Método de enseñanza:
Clases presenciales:
Clases teóricas 24h
Clases prácticas 12h
Clases no presenciales: 28h
Trabajo del alumno 34h
Evaluación del alumno 2h
Total: 100 horas (4 créditos ECTS)
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